MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 chromosome

Total Repeats: 95561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011353	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	209397020
2	NC_011353	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209397020
3	NC_011353	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209397020
4	NC_011353	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209397020
5	NC_011353	CAC	3	9	225	233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209397020
6	NC_011353	ACCATT	2	12	238	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209397020
7	NC_011353	A	6	6	292	297	100 %	0 %	0 %	0 %	209397020
8	NC_011353	T	8	8	320	327	0 %	100 %	0 %	0 %	209397020
9	NC_011353	AAC	2	6	347	352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209397020
10	NC_011353	CGG	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209398223
11	NC_011353	CAGG	2	8	437	444	25 %	0 %	50 %	25 %	209398223
12	NC_011353	CT	3	6	462	467	0 %	50 %	0 %	50 %	209398223
13	NC_011353	ACCA	2	8	483	490	50 %	0 %	0 %	50 %	209398223
14	NC_011353	TGG	2	6	493	498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209398223
15	NC_011353	GAT	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
16	NC_011353	A	6	6	508	513	100 %	0 %	0 %	0 %	209398223
17	NC_011353	CGC	3	9	587	595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209398223
18	NC_011353	TCG	2	6	631	636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398223
19	NC_011353	CGCTG	2	10	710	719	0 %	20 %	40 %	40 %	209398223
20	NC_011353	GC	3	6	771	776	0 %	0 %	50 %	50 %	209398223
21	NC_011353	CTG	2	6	813	818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398223
22	NC_011353	CCG	2	6	866	871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209398223
23	NC_011353	CCG	2	6	925	930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209398223
24	NC_011353	TGG	2	6	949	954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209398223
25	NC_011353	ACT	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398223
26	NC_011353	CGG	2	6	985	990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209398223
27	NC_011353	GCTG	2	8	992	999	0 %	25 %	50 %	25 %	209398223
28	NC_011353	TTG	2	6	1016	1021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209398223
29	NC_011353	GGAC	2	8	1030	1037	25 %	0 %	50 %	25 %	209398223
30	NC_011353	TA	3	6	1048	1053	50 %	50 %	0 %	0 %	209398223
31	NC_011353	GTT	2	6	1085	1090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209398223
32	NC_011353	TTC	2	6	1144	1149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209398223
33	NC_011353	TGA	2	6	1250	1255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
34	NC_011353	AAT	2	6	1290	1295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209398223
35	NC_011353	GGC	2	6	1346	1351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209398223
36	NC_011353	GC	3	6	1350	1355	0 %	0 %	50 %	50 %	209398223
37	NC_011353	TGC	2	6	1361	1366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398223
38	NC_011353	GTG	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209398223
39	NC_011353	ATC	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398223
40	NC_011353	TG	3	6	1452	1457	0 %	50 %	50 %	0 %	209398223
41	NC_011353	AAG	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209398223
42	NC_011353	GGT	2	6	1553	1558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209398223
43	NC_011353	TCT	2	6	1653	1658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209398223
44	NC_011353	GAT	2	6	1689	1694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
45	NC_011353	TCA	2	6	1718	1723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398223
46	NC_011353	GCT	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398223
47	NC_011353	GAA	2	6	1826	1831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209398223
48	NC_011353	GAA	2	6	1920	1925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209398223
49	NC_011353	ATC	2	6	1984	1989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398223
50	NC_011353	TTG	2	6	2005	2010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209398223
51	NC_011353	CCAG	2	8	2020	2027	25 %	0 %	25 %	50 %	209398223
52	NC_011353	TCG	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398223
53	NC_011353	TAC	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398223
54	NC_011353	TGA	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
55	NC_011353	TGA	2	6	2239	2244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
56	NC_011353	GAT	2	6	2367	2372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
57	NC_011353	ATTGAA	2	12	2448	2459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209398223
58	NC_011353	TGC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398223
59	NC_011353	CGA	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209398223
60	NC_011353	CG	4	8	2543	2550	0 %	0 %	50 %	50 %	209398223
61	NC_011353	TGA	2	6	2564	2569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
62	NC_011353	TGA	2	6	2600	2605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
63	NC_011353	TAT	2	6	2703	2708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209398223
64	NC_011353	TGC	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398223
65	NC_011353	GCG	2	6	2881	2886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209395861
66	NC_011353	CAA	2	6	2955	2960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395861
67	NC_011353	GCAA	2	8	3047	3054	50 %	0 %	25 %	25 %	209395861
68	NC_011353	GGT	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209395861
69	NC_011353	ATGA	2	8	3145	3152	50 %	25 %	25 %	0 %	209395861
70	NC_011353	GCA	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209395861
71	NC_011353	TGG	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209395861
72	NC_011353	TGA	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395861
73	NC_011353	GAA	2	6	3283	3288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395861
74	NC_011353	CAT	2	6	3294	3299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395861
75	NC_011353	CAGC	2	8	3300	3307	25 %	0 %	25 %	50 %	209395861
76	NC_011353	TGA	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395861
77	NC_011353	CGC	2	6	3403	3408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209395861
78	NC_011353	ATTGC	2	10	3413	3422	20 %	40 %	20 %	20 %	209395861
79	NC_011353	TTCA	2	8	3445	3452	25 %	50 %	0 %	25 %	209395861
80	NC_011353	TGA	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395861
81	NC_011353	AGCG	2	8	3582	3589	25 %	0 %	50 %	25 %	209395861
82	NC_011353	TCCGGC	2	12	3595	3606	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209395861
83	NC_011353	TG	3	6	3623	3628	0 %	50 %	50 %	0 %	209395861
84	NC_011353	CGG	2	6	3722	3727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209395861
85	NC_011353	T	6	6	3838	3843	0 %	100 %	0 %	0 %	209396634
86	NC_011353	CTGA	2	8	3868	3875	25 %	25 %	25 %	25 %	209396634
87	NC_011353	TGA	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396634
88	NC_011353	TGA	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396634
89	NC_011353	GC	3	6	3978	3983	0 %	0 %	50 %	50 %	209396634
90	NC_011353	CGG	2	6	4077	4082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209396634
91	NC_011353	GGC	2	6	4270	4275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209396634
92	NC_011353	TGA	3	9	4341	4349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396634
93	NC_011353	CTA	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209396634
94	NC_011353	GC	3	6	4459	4464	0 %	0 %	50 %	50 %	209396634
95	NC_011353	CGG	2	6	4511	4516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209396634
96	NC_011353	CTG	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209396634
97	NC_011353	TGC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209396634
98	NC_011353	AAC	2	6	4669	4674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209396634
99	NC_011353	GTT	2	6	4692	4697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209396634
100	NC_011353	CCG	2	6	4698	4703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209396634
101	NC_011353	GCC	2	6	4735	4740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209396634
102	NC_011353	GAT	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396634
103	NC_011353	AG	3	6	4899	4904	50 %	0 %	50 %	0 %	209396634
104	NC_011353	CCG	2	6	4991	4996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209396634
105	NC_011353	TGC	2	6	5001	5006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209396634
106	NC_011353	TGA	3	9	5018	5026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396634
107	NC_011353	ATC	2	6	5027	5032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209396634
108	NC_011353	TTA	2	6	5379	5384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209399918
109	NC_011353	TGG	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209399918
110	NC_011353	ACA	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209399918
111	NC_011353	CCG	2	6	5467	5472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209399918
112	NC_011353	CCG	2	6	5476	5481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209399918
113	NC_011353	TCA	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209399918
114	NC_011353	ATC	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209399918
115	NC_011353	CGG	2	6	5514	5519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209399918
116	NC_011353	GCT	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209400824
117	NC_011353	GGA	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209400824
118	NC_011353	TCA	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209400824
119	NC_011353	AAG	2	6	5758	5763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209400824
120	NC_011353	CAGT	2	8	5783	5790	25 %	25 %	25 %	25 %	209400824
121	NC_011353	AAT	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209400824
122	NC_011353	TCA	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209400824
123	NC_011353	TTC	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209400824
124	NC_011353	TTC	2	6	5929	5934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209400824
125	NC_011353	CAC	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209400824
126	NC_011353	TGC	2	6	5994	5999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209400824
127	NC_011353	TTG	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209400824
128	NC_011353	TGA	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209400824
129	NC_011353	GCGG	2	8	6116	6123	0 %	0 %	75 %	25 %	209400824
130	NC_011353	AAATCG	2	12	6169	6180	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	209400824
131	NC_011353	AGCG	2	8	6287	6294	25 %	0 %	50 %	25 %	209400824
132	NC_011353	CTG	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209400824
133	NC_011353	GTG	2	6	6418	6423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209400824
134	NC_011353	CAT	2	6	6560	6565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398740
135	NC_011353	GCC	2	6	6777	6782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209398740
136	NC_011353	GTT	2	6	6831	6836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209398740
137	NC_011353	AGA	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209398740
138	NC_011353	ATC	2	6	7075	7080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398740
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140	NC_011353	TGCCGC	2	12	7125	7136	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209398740
141	NC_011353	CGC	2	6	7221	7226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209398740
142	NC_011353	GCC	2	6	7227	7232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209398740
143	NC_011353	GCCA	2	8	7244	7251	25 %	0 %	25 %	50 %	209398740
144	NC_011353	TTA	2	6	7301	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209398740
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148	NC_011353	CGG	2	6	7718	7723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209398740
149	NC_011353	CG	3	6	7763	7768	0 %	0 %	50 %	50 %	209398740
150	NC_011353	CAA	2	6	7897	7902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209398740
151	NC_011353	TAA	2	6	7952	7957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209398740
152	NC_011353	A	6	6	7963	7968	100 %	0 %	0 %	0 %	209398740
153	NC_011353	GCAT	2	8	7973	7980	25 %	25 %	25 %	25 %	209398740
154	NC_011353	CGT	2	6	8188	8193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399547
155	NC_011353	ATC	2	6	8197	8202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209399547
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157	NC_011353	CAAC	2	8	8352	8359	50 %	0 %	0 %	50 %	209399547
158	NC_011353	TC	3	6	8363	8368	0 %	50 %	0 %	50 %	209399547
159	NC_011353	CGCAG	2	10	8377	8386	20 %	0 %	40 %	40 %	209399547
160	NC_011353	TTGA	2	8	8405	8412	25 %	50 %	25 %	0 %	209399547
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163	NC_011353	CAG	2	6	8456	8461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209399547
164	NC_011353	TGC	2	6	8677	8682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399547
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168	NC_011353	AAGA	2	8	8828	8835	75 %	0 %	25 %	0 %	209399547
169	NC_011353	AGA	2	6	8848	8853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209399547
170	NC_011353	TAC	2	6	8888	8893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209399547
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175	NC_011353	CTG	2	6	9200	9205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399547
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259	NC_011353	TCT	2	6	13689	13694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209399575
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